就像我们在内部争论和打架一样，我们的微生物也是如此。 “你的脏包撞到我腿上了，”一个 占座男 咆哮道，我上周末挤进了纽约地铁的一个相邻座位。“你道歉吗，否则我要打你！”
抱歉，伙计。但正如你害怕手提包上的细菌一样，细菌是无法逃脱的。康奈尔大学医学遗传学家克里斯托弗·梅森表示，虽然每天有数百万人争夺座位，但地铁表面上的微生物（细菌、古菌、真菌）数量却远远多于人类。细菌确实会让我们生病，但越来越明显的是，我们的健康也取决于我们体内（人类微生物组）以及我们所处建筑环境中的微生物。虽然地铁是世界各地人们日常通勤的一个标志性特征，但关于它们如何影响细菌的生活，人们知之甚少。
今年早些时候，梅森及其同事通过对构成地下“大杂烩”的人类、动物、植物和害虫的微生物物种进行首次全系统 DNA 图谱，开始填补这些空白。最引人注目的是，近一半的 DNA 与任何已知的有机体都不匹配。但这是规划和公共卫生专家的基准，他们设想未来的地铁将被设计成最大限度地繁殖有益细菌。因此，阿尔弗雷德·P·斯隆基金会出资启动一项针对全球地铁系统微生物涨落的研究（尽管当地很热闹，但纽约仅是世界第七大繁忙的地铁系统）。
上周六，在纽约基因组中心，梅森召开了首次年度国际科学家会议，主题为“MetaSUB”。这次会议与前一天纽约科学院举办的“城市中的微生物”活动相呼应，后者是建筑环境微生物学的一次预热。
MetaSUB 会议的讨论集中在研究设计和解读的细节上。在爱干净如日本东京，收集足够的 DNA 可能具有挑战性，那里的清洁工可能每天会擦拭表面数次。这在新闻中不成问题，因为如果说纽约有什么方面比较随意，那就是清洁。纽约 MTA（大都会运输署）的清洁频率是每几周一次，而在波士顿，哈佛大学公共卫生学院的柯蒂斯·赫滕豪尔表示，MBTA（马萨诸塞湾交通局）对清洁的回应是：“我们不清洁。”
另一个问题是能否找到足够的人来拭子采集地铁表面样本。在他的首次研究中，梅森动员了大量的学生和志愿者，从座位、扶手、门和闸机上收集了 1,450 个 DNA 样本。从圣保罗到东京，志愿者是微生物组研究的生命线。事实上，梅森的团队正在积极招募志愿者参加将于 7 月 15 日举行的纽约地铁新“Swabventure”（拭子探险）。
目标是通过将微生物生态系统置于中心位置，“转变城市设计的范式”。有一天，匆忙的通勤者可能会穿过注入益生菌的地铁隧道。但首先，正如梅森的团队在亲身经历中所了解到的，准确识别有机体是一个挑战，他们发现了一些 DNA 片段，这些片段类似于鼠疫耶尔森氏菌，或者说是 鼠疫——但也可能与其他有机体匹配。
虽然鼠疫耶尔森氏菌不是纽约的原住民，但《纽约时报》曾报道，它确实在美国西部爆发，那里由“被跳蚤咬的野生动物”传播。我来自西部。但我上周六并没有把一只草原犬藏在我的手提包里，乘坐开往曼哈顿的 F 线地铁。
致那位与占座男争吵的地铁乘客：感谢您保护我的细菌。
