想要更好的玉米?给它的细胞着色。

了解关键作物的基因可以帮助养活一个饥饿的世界。
A thin section of a maize ear at a very early stage of development (about 3 millimeters long). Each color represents the expression of a different gene in stem cells and associated cells.
玉米穗在早期发育阶段(约3毫米长)的薄切片。每种颜色代表不同基因在茎细胞及相关细胞中的表达。来源:CSHL

尽管美国去年仅种植了150亿蒲式耳玉米,但我们对玉米的茎细胞仍然知之甚少。这可能看起来是一个小问题,但这些细胞在决定植物重要的生长、健康和抗逆性方面起着至关重要的作用。识别负责这些和其他因素的特定基因,可以帮助农业科学家培育更强壮的作物——鉴于粮食不安全和气候变化的挑战,这是一个至关重要的需求。

“人们非常兴奋的一件事是培育出更具韧性或更具生产力的新作物,”冷泉港实验室植物生物学家David Jackson在一份声明中说。“我们还没有一个完整的调控因子列表——即我们实现这一目标所需的基因。”

在分析了数千个细胞样本后,Jackson及其同事首次绘制出了两个著名的茎细胞调控因子的图谱。他们的研究结果发表在期刊《Developmental Cell》上,可能会很快为农业产业带来欢迎的推动,并促进其他植物物种的类似项目。

该团队选择CLAVATA3WUSCHEL作为其项目的调控因子。为了收集样本,他们小心地解剖了玉米和拟南芥植株幼芽的微小部分,以获取其茎细胞。然后,他们使用微流控设备分离每个细胞,将其RNA转化为DNA,然后用一个标签标记所得DNA,将该标签与其原始细胞关联起来。这种方法称为单细胞RNA测序,使科学家能够同时检查数千个细胞的基因表达情况。据Jackson介绍,这些结果构成了一个开源的“基因表达图谱”,包含大约5000个表达CLAVATA3和1000个表达WUSCHEL的细胞。

“当我们发布这个时,整个社区都可以使用它,”Jackson说。“对玉米或拟南芥茎细胞感兴趣的其他人不必重复实验。他们将能够使用我们的数据。”

在此基础上,Jackson的团队在玉米和拟南芥样本中都发现了数百个优先表达的基因。它们在这两个物种中都存在,这表明它们在许多不同植物品种中具有进化上的重要性。最后,专家们确定了负责玉米生产力的茎细胞调控因子。

“这是可以指导未来十年研究的基础知识,”Jackson解释道。“它不仅可以被发育生物学家使用,还可以被生理学家使用,他们思考玉米穗如何生长以及如何提高产量,然后是育种家。”

各种玉米品种在特定产品上的适应性不同。例如,一种最适合用作动物饲料的品种,可能无法提供燃料生产所需的相同化学成分。通过扩展这个基因表达图谱,研究人员相信农民将很快能够根据自身需求选择最合适的玉米作物,并杂交出更有前景的品种。

 

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